● 摘要
沼泽山雀(Poecile palustris),隶属鸟纲(Aves),雀形目(Passeriformes), 山雀科(Paridae), Poecile属,是典型的小型食虫鸟, 同时也是一种广布的常见鸟,具有重要的科研价值和保护意义。
遗传多样性一直都是生物多样性研究的热点问题,对遗传多样性进行探究和解析是我们进一步了解该物种种群发展和维持的基础。本研究通过使用COI基因以及微卫星标记对中国沼泽山雀种群进行了种群遗传多样性分析,主要获得以下结果:
对黑龙江尚志、吉林左家、辽宁宽甸、湖北神农架、内蒙古阿尔山、内蒙古莫尔道嘎、山西历山、陕西佛坪、陕西太白、陕西延安、云南玉龙雪山及蒙古国采集中国地区的沼泽山雀62只个体进行了基于线粒体COI基因的遗传多样性分析。研究获得了每条1201bp的沼泽山雀线粒体COI基因序列,变异位点 90个,约占总数量的8.1%。COI基因序列A+T含量(49%)稍低于G+C含量(51%),差异不显著,与鸟类线粒体DNA碱基组成的特点一致。根据碱基替换饱和分析,碱基替换未达到饱和。62 个样本的线粒体COI基因序列共分为30个单倍型。单倍型多样性(Hd)为0.933,平均核苷酸多样性(π)为0.01828。62个个体均具有高的单倍型多样性和低的核苷酸多样性的特点,说明沼泽山雀的遗传多样性处于中等水平。
基于ML和贝叶斯构建的系统发育树结果显示:吉林左家、辽宁宽甸以及蒙古国的物种聚为一支。云南地区物种单独聚为一支。分布于陕西佛坪、陕西太白和陕北延安的物种聚在一起。而太白地区和山西历山的物种聚在一个小分支。湖北神农架和陕西佛坪的物种聚为另一小支。
本研究利用筛选出的9对微卫星标记对中国地区沼泽山雀进行了遗传多样性分析,群体中共检测到等位基因74个,等位基因数在3-20之间变化。观察微卫星位点的平均观测等位基因数为8.222,平均有效等位基因数为1.880,平均观测杂合度为0.331,平均期望杂合度为0.371,多态信息含量PIC从0.085-0.886。所检测位点中,绝大多数位点的基因型都偏离Hardy-Weinherg平衡状态。
本研究通过以微卫星和线粒体COI基因序列为分子标记,对中国沼泽山雀的遗传多样性和遗传结构进行了分析,为后续深入的种群谱系地理结构与形成机制研究奠定了基础。虽然目前沼泽山雀的种群具有中等遗传多样性水平,存在多样化的谱系分布,但沼泽山雀的资源量存在下降趋势,应加以保护。
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