● 摘要
混合并行计算技术（Hybrid Parallel Computing， HPC）使得我们可以在桌面计算机上运行一些计算密集型的应用。作为在分子动力学中有着广泛应用的一类计算密集型计算，AMBER 力场的计算通常需要使用超级计算机。本文的研究目标就是实现在桌面计算机上的大规模计算。本文实现了在CPU 与Intel 协处理器组成的异构平台上的
AMBER力场计算，并可以指定并行线程数。消息传递接口（Message Passing Interface，MPI）被用来实现基于任务和基于数据的并行性。实验结果表明该方法能获得显著的性能提升。
尽管已经取得了相当大的进步，它依然是非常活跃的研究领域。最活跃的研究点包括动态并行、性能提升、处理时间的最小化等等，这些需要在今后的研究中加以探讨。
本文通过充分挖掘利用处理器与协处理器组成的混合架构的计算性能，提出了一种计算耗时短且带宽利用率高的解决方案。