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题目:网翅蝗科部分种类线粒体16S rRNA基因的分子进化与系统学研究

关键词:网翅蝗科 线粒体DNA 16SrRNA 系统发育

  摘要

蝗虫是农业上的重要害虫之一,它对农业生产可造成直接危害,由于蝗虫对农牧业的影响,对蝗虫系统学以及蝗虫防治的研究一直受到广泛重视。网翅蝗科(Arcypteridae)隶属于直翅目蝗亚目蝗总科(Orthoptera: Caelifera: Acridoidae)。是蝗总科中较大的一个科。目前国内外对网翅蝗科昆虫的分子系统学研究远远落后于其它生物类群。本论文从分子生物学的角度入手,采用线粒体16S rRNA基因为分子标记,共获得网翅蝗科2个亚科11属24种及槌角蝗科2属2种昆虫长度为522bp的部分序列,应用分子生物学软件对结果进行分析,使用常见的建树方法:NJ法、ME法和MP法重建系统发育树,对网翅蝗科部分种类的系统关系进行研究,为探讨网翅蝗科昆虫的分子进化,确定它们之间的关系提供分子生物学方面的证据。
通过对结果的分析讨论,得出以下结论
1. 扩增出的25条16SrRNA基因中,A、T、G、C平均含量分别为31.1%、38.3%、18.2%和12.4%,A+T含量为69.4%,G+C含量为30.6%。表现出A+T含量明显高于G+C含量,高于昆虫A+T的平均值(64%),反映出16SrRNA基因在碱基组成存上具有偏向性,这同其他昆虫相类似。其序列组成分析显示典型的高AT含量和多变的距离依赖的转换/颠换(TS/TV)比。
2. 在所获得的25条16SrRNA基因序列中(不包括外群)核苷酸的替换总体上表现出转换略高于颠换。但是环区颠换要高于转换,转换主要是A与G之间的转换,而颠换主要发生在A与T之间。饱和性分析结果表明16S rDNA的环区存在部分饱和现象。
3. 26种昆虫之间的遗传距离显示,同一属内种间的遗传距离较小,如西藏竹蝗和黑翅竹蝗之间的遗传距离为0.002,白纹雏蝗和夏氏雏蝗间的遗传距离为0,总的来说,属间的遗传距离大于种间的遗传距离,属间的遗传距离大约介于0.100~0.060之间,与外群飞蝗间的遗传距离最大,介于0.1220~154之间。
4. 所研究的网翅蝗科部分种类的系统发育关系:
①认为网翅蝗科并非一单系群;
②竹蝗亚科的单系性也得不到支持, 需采用进行进一步的研究;
③网翅蝗科各属间的系统发生关系为:((肿脉蝗属+(牧草蝗属+异爪蝗属)+草地蝗属)+雏蝗属)+(凹背蝗+石牺蝗属)+((网翅蝗属+曲背蝗属)竹蝗属);
④支持雏蝗属不是单系群,雏蝗属种间关系较为复杂,有待进一步研究。
5.本研究运用16SrRNA基因序列,对网翅蝗科部分种类进行系统关系研究, 发现16SrRNA基因在用于网翅蝗科属种间阶元的研究时不理想。