● 摘要
雀形目种类繁多分布广泛，我国就有661种，约占我国鸟类总数的55.7%。 该类群的演化关系以及各科物种起源问题一直是鸟类学研究的热点问题，尤其是在确定山雀科和长尾山雀科的分类地位上存有很大争议。本文采用PCR扩增产物直接测序法测定了大山雀和绿背山雀两种山雀科鸟类线粒体基因组全序列，并结合本实验室已测的7条及GenBank中收录的39条雀形目鸟类线粒体全基因组序列，分别采用MrBayes 3.1.2软件、PAUP 4 beta软件和RAxML-7.0.3软件重建了雀形目部分鸟类系统发育进化树。主要结果如下：
1.大山雀线粒体基因组全长为16772 bp，绿背山雀线粒体基因组全长16771 bp，编码区均有22个转运tRNA基因，13个蛋白基因和2个rRNA基因，非编码区长度分别为1187bp和1188bp，均只有一个控制区。两种鸟类线粒体全基因组的A+T碱基组成十分相似，大山雀为52.1%，绿背山雀为52%。在密码子使用方面，两种鸟类各自的13个蛋白编码基因的起始密码子除COⅠ基因密码子为GTG外，其余的都均为典型的ATG。而终止密码子的使用中，发现ND4和COⅢ基因为不完全终止密码子T，其它的为典型的鸟类终止密码子AGA,TAA, TAG和AGG。
2.所研究物种的7个科之间平均遗传距离为0.515，山雀科与燕科之间为0.319，而与长尾山雀科之间的遗传距离为0.539，燕科与长尾山雀科之间为0.484；科内物种之间的遗传距离分别是燕科0.094，鸦科0.211，山雀科0.282，鹟科0.420，莺科0.620，长尾山雀科0.735，山雀科0.329。
3.使用贝叶斯法、最大简约法以及快速似然法对13个蛋白质编码数据集以及ND4&ND5联合数据集构建的系统发育树结果显示，两个数据集的BI树和MP树拓扑结构一致，而与ML树的拓扑结构稍有差异。总体来说，莺科并非单系群，鸦科，山雀科，长尾山雀科均为单系群。支持将长尾山雀科与山雀科划分为两个独立的科。ND4&ND5基因构建的系统发生树在科级水平上阐述雀形目各科系统发育关系时具有较高的效力，在一定程度上能够代表雀形目的系统发生关系。