根据《中华人民共和国公路法》的规定，擅自占用挖掘公路由交通主管部门责令停止违法行为，可以处以三万元以下的罚款。该规定提到的“以下”说明包括三万元 正确。 错误。
对管辖发生争议的路政案件，报请共同的上一级人民政府交通主管部门或者其设置的公路管理机构指定管辖。 正确。 错误。
县级以上地方人民政府交通主管部门可以决定由公路管理机构依据《公路法》规定行使公路行政管理职责。 正确。 错误。
对于车货总质量在40000千克以上的超限运输，承运人应在起运前1个月内提出书面申请。 正确。 错误。
根据《公路法》规定，造成公路路面损坏、污染或者影响公路畅通的，由交通主管部门责令停止违法行为，可以处一千元以下罚款。 正确。 错误。
跨省（自治区、直辖市）行政区域进行超限运输的由交通部负责审批。
