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题目:Sox 9α基因在中国林蛙中的表达模式及OP对精巢中Sox 9α表达的影响

关键词:Sox 9α,克隆,中国林蛙,精巢,辛基酚

  摘要


为探讨Sox 9α在中国林蛙(Rana chensinensis)成体性腺功能的维持中的作用以及辛基酚(Octylphenol, OP)对Sox 9α表达的影响。本研究首先克隆了中国林蛙精巢的Sox 9α基因,将其测序结果导入SeqMan序列拼接;分别用Blast, ORF, SignalP, ProParam, SMART, NPS@, SWISS-MODEL软件进行同源性分析,预测序列的开放阅读框、信号肽、蛋白分子重量、功能结构域、等电点、蛋白质的二级和三级结构。然后,选取两栖和爬行动物的12个物种进行ClustalW2比对,MEGA5.1建树,分析中国林蛙Sox 9α基因的进化地位。其次,用Semi-quantity RT-PCR检测Sox 9α在中国林蛙成体的精巢、卵巢、肾脏、肝脏、脑以及32-46期蝌蚪的表达。最后,将雄性中国林蛙成体暴露于10-5, 10-6, 10-7, 10-8 mol/L OP进行处理,分别在10、20和30d取其精巢,用Real-time Quantity PCR技术检测Sox 9α在精巢的表达。结果与分析如下:
1.在中国林蛙成体精巢中首次扩增到长为1580bp的Sox 9α cDNA序列,该序列包含一个1449bp的开放阅读框,其起始密码子与粗皮蛙(Rana rugosa)的位置一致。可编码一个含有482个氨基酸的蛋白分子,该氨基酸序列与粗皮蛙Sox 9α的相似度为97%,且无移码读码现象。与爬行动物密西西比鳄(Alligator mississippiensis) Sox 9α的相似度为85%,与红耳龟(Trachemys scripta) Sox 9α的相似度为85%。将该序列上传GenBank,其序列号为KC442293。对Sox 9α氨基酸序列的结构和功能进行预测,该序列不存在N-端信号序列,是一个非分泌蛋白,其分子重量为54 kDa,等电点为6.32。序列内除含HMG-box domain (105-175)外,还含有BEN domain (75-147), DnaJ domain (107-152), GIT domain (120-150), CG-1 domain (237-276), HSF domain (135-291), PAH domain (376-414)和DUF1518 (304-354) domain等结构域。蛋白质二级结构包含17.39%的α-螺旋,5.38%的延伸链和77.23%的自由卷曲。
2. ClustalW2比对并MEGA5.1建树显示,中国林蛙Sox 9α氨基酸序列在HMG-box结构域保守性较高。所选取的12个物种的进化关系可分为有尾两栖类、无尾两栖类和爬行类3群。中国林蛙和粗皮蛙共处一群,二者在进化关系上较为亲近。
3. Semi-quantity RT-PCR检测显示,Sox 9α在中国林蛙的精巢、卵巢、肾脏、肝脏和脑中均有表达,在精巢和卵巢中均显著表达。在32-38期幼体,43-45期雌雄个体及46期雌性个体中均有表达。表明Sox 9α可能参与幼体的性腺分化和维持成体性腺的功能。
4.将成体雄性林蛙暴露OP后,用Q-PCR技术检测精巢中Sox 9α mRNA显示,与对照组相比,各OP处理组Sox 9α mRNA的表达均显著下调。其中,暴露10 d,10-8 mol/L OP组的Sox 9α mRNA开始显著下降,随后呈现明显的剂量依赖性降低。暴露20 d,除10-8 mol/L OP组外,其他各组Sox 9α mRNA水平均呈现明显的剂量依赖性增高。暴露30 d,随着OP浓度的增加,Sox 9α mRNA的表达与OP浓度之间的关系不规律。总体显示,OP暴露可下调Sox 9α mRNA表达,但Sox 9α mRNA表达下降的程度与OP浓度、暴露时间之间关系的规律性不强。
5.原位杂交结果显示,Sox 9α mRNA阳性表达信号主要存在于林蛙精巢的生精细胞。
 
关键词: Sox 9α,克隆,中国林蛙,精巢,辛基酚