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题目:中国叶甲科昆虫部分种类线粒体COI基因的分子进化与系统学研究

关键词:Molecular Phylogenetic Research on mtDNA COI Gene of Chrysomelidae

  摘要

  叶甲科(Chrysome lidae)昆虫也称“金花虫"、“花潜”,属鞘 翅目(C0leoptera)叶甲总科(Chrysomeloidea),分布于世界各地,以温 带、亚热带地区种类最丰富。本科中的许多种类是农林、蔬菜、牧草的 重要害虫,危害植物的叶、茎及根部。叶甲作为农牧业重要的害虫一直受 到生物学家们的重视。生物学工作者长期以来为了寻求叶甲防治方法, 一直进行着有关叶甲生物学的基础研究,包括系统学研究。在分类系统 上,最初是集中在形态学方面,随着科学技术的发展,各种研究也日趋 广泛和深入。上世纪末,研究者开始进行一些亚显微结构及分子方面的 研究。近年来,昆虫系统演化热点已转入分子水平。线粒体基因组由于 其特有的遗传学特点,成为研究真核生物分子遗传学、发育生物学和分 子系统进化的一种重要的模式体系。线粒体细胞色素C氧化酶亚基I基 因由于其分布的普遍性、序列和结构的相对保守性而被广泛应用于不同 分类阶元层次上的分子系统学研究。本研究采用PCR产物直接测序法测 定了叶甲科3个亚科lO属14种昆虫COl基因,并从NCBI下载了四种相 关叶甲昆虫的462bpCOI基因片段,同时还从NCBI下载一种负泥虫 Crioceris duodecimpunctata的相应序列为外群序列。利用ClustalX 进行序列比对, MEGA2.1进行序列组成统计。PAUP,4.O blO(PPC)对数 据集系统发育信号进行评估,并以NJ、MP,ML和贝叶斯系统发育推论法 分别重建系统发生树。得出结论如下:   1、对18种叶甲线粒体COl基因序列进行分析,COl基因序列表现 出一定的A+T偏向性(64.6%)。碱基转换替换呈现T←→C偏向性;颠换 的发生主要以T←→A为主,且大都发生在密码子第三位。   2、叶甲线粒体COl基因中核苷酸的替代转换与颠换值之比R为0.9: 转换和颠换与遗传距离呈线性关系;说明转换和颠换尚未达到饱和。R 值表现了昆虫线粒体DNA的典型的距离依赖性。对数据组进行树长分布 分析和PTP检验,两者均显示该数据组包含较强的系统发育信号。   3、基于COI基因在MEGA2.1中构建了叶甲科的NJ、MP树,在 PAUP4.O*b中分别构建了叶甲科的NJ、MP、ML、BI基因树及四种树的合 一树,并采用基于似然值的KH-和SH检验比较了这些系统树,结果认为 ML树的似然值(一Ln L)最小,但它们的似然值差异没有达到统计学显 著性。除PAUP4.O*b中的MP树外,各树的一致性和统计学支持较好,同 一属内的种间以很高的置信度优先聚一枝,亚科内的不同属间基本为单 系性,且枝间分歧小于枝内分歧。   4、发现瓢萤叶甲属Oides总是和叶甲亚科Chrysomelinae聚在一起, 然后与跳甲亚科A1ticinae相聚。笔者认为将瓢萤叶甲属归于萤叶甲亚 科Galerucinae似乎有待商榷。 克萤叶甲属 Cneorane和守瓜属 Aulacophora的亲缘关系非常亲密。   5、叶甲亚科和跳甲亚科的关系似乎更近缘,而萤叶甲亚科和前两者 的关系较远。这一结论与前人在形态学、支序系统学、及细胞分类学的 结论相矛盾。   6、运用COI基因的核苷酸序列对叶甲科昆虫进行系统研究时,各属 种间的分类关系都比较明确,得到的树的拓扑结构大都一致。因此,COI 基因在对叶甲科科下种属阶元的分类与进化关系研究中,是一个有效的 分子标记。但在亚科水平的分析中,可能还存在一定的不足。   本研究对叶甲科14种昆虫mtDNA COI基因的部分序列进行了测定, 通过向GenBank提交所测叶甲基因序列,与世界昆虫学界共享序列数据。 通过后续分析,对COI基因在叶甲科昆虫中的分子进化特性与系统发育 应用进行了初步研究,为探讨中国叶甲科昆虫的分子进化,建立该科分 子水平系统发育关系提供分子生物学方面的证据,有助于建立正确与完 善的分类体系。