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题目:川金丝猴肠道微生物的分子生态学研究

关键词:川金丝猴 肠道菌群 DGGE 实时定量PCR

  摘要


肠道菌群与宿主是协同进化的关系,它们和宿主的食物消化、营养的吸收、能量的消耗和供应、免疫调节等很多方面都存在着紧密的联系。一般情况下,菌群和宿主之间以及菌群、宿主和环境之间形成了动态平衡,从而存在一个互相依  存、相互制约的体系。肠道菌群的生长环境复杂,厌氧微生物是其主要的组成部分,故采用传统培养技术对肠道菌群的研究受到了很大制约。分子生物学技术的应用使肠道菌群的研究更加直接和深入。
川金丝猴(Rhinopithecus roxellana)被称作第二国宝,是国家一级保护动物,世界级珍稀物种。目前为止,国内外对川金丝猴的形态学描述、分布、种群数量变化、食性、活动规律、繁殖习性、社会行为、遗传多样性及保护等方面进行了研究。而对于川金丝猴肠道菌群的研究尚未见报道。
本课题采用DGGE和实时定量PCR等分子生物学方法对川金丝猴肠道菌群的群落结构多样性进行了研究,探讨了川金丝猴肠道菌群随季节变化的规律,并对圈养和半驯化川金丝猴肠道菌群的多样性进行了比较。本研究的主要结果如下:
1)  因其生活环境比较稳定,圈养川金丝猴肠道菌群的多样性随季节改变并没有表现明显差异。但是在不同的季节,其肠道菌群的优势菌群有所不同。
2)  半驯化川金丝猴的肠道菌群多样性随着季节更替有一定差异,但没有显著性。在同一季节,圈养与半驯化川金丝猴的肠道菌群多样性亦没有表现出明显差异。圈养和半驯化川金丝猴不同个体之间的肠道菌群多样性也没有明显差异。但是在不同季节圈养和半驯化川金丝猴其肠道菌群优势菌群不同。
3)  圈养和半驯化的川金丝猴优势条带、特征条带、共有条带的测序结果表明,川金丝猴肠道菌群中的大部分依然是未知的,在已知的部分,主要以厚壁菌门(Firmicutes)和拟杆菌门(Bacteroidetes)为主。
4)  使用PCR技术和实时定量PCR,在圈养和半驯化川金丝猴的肠道内仅检测到拟杆菌。随着季节的变化,拟杆菌(Bacteroide)的数量在圈养和半驯化川金丝猴并未发生变化。    
 5)以上结果说明人工投食及季节的变化对川金丝猴肠道菌群的遗传多样性不会产生明显的影响。双歧杆菌和乳酸杆菌在川金丝猴肠道菌群中所占的比例低于1%,以后对川金丝猴投取食物时可以适当的添加乳酸杆菌(Lactobacillus)和双歧杆菌(Bifidobacterium)菌剂对川金丝猴的肠道菌群进行一定的改良。